ちょっと前の事ですが、アプリ内で表示している広告内容がダメってことでリジェクトになったことがあります。
広告はiAdとAdMobを利用しているのですが、問題になったのはAdMobの広告です。親切にも問題になった広告のスナップショットを送ってきてくれました。確かにこれは良くないな・・・

とりあえずAdMobのフィルターでApple関連のものをブロックして再提出してリリースされました。
たぶん極稀な事だと思うのですが、とにかく早くリリースしたい場合は広告内容にも気をつけたほうがよいかと思います。